És important que els desaprofitaments orgànics i biodegradables es dipositin per separat, evitant que entrin en contacte amb altres materials. Només així es podrà facilitar el seu tractament en les plantes de reciclatge corresponents. S'aconsella que es dipositin en bosses d'escombraries dins del contenidor per motius d'higiene.

El contenidor marró s'usa per a emmagatzemar deixalles com closques d'ou i restes de carn, peix, mariscos, fruites, verdures i fruita seca; restes d'infusions i cafès, tovallons usats, taps de suro, llavors, fulles seques, restes de pa, etc., i cal evitar aquells que no es puguin aprofitar, o fracció de resta. Aquests últims, com burilles, compreses, bolquers, pols i brutícia domèstica, entre altres, es llancen al contenidor gris.

Les escombraries orgàniques són el residu més abundant i aprofitable. A l'estat espanyol suposen el 40% del contingut de la galleda d'escombraries en el domicili. Quan se separa i recicla de manera correcta en el contenidor marró ens permet obtenir dos productes diferenciats. D'una banda, s'aconsegueix biogàs, que, com a font d'energia renovable, es pot fer servir en espais domèstics o per a impulsar mitjans de transport, reduint la contaminació ambiental. D'altra banda, els desaprofitaments sòlids resultants del biogàs es poden emprar com a compost o fertilitzant natural que enriqueix el sòl i afavoreix el cultiu.