Unió de Pagesos no està d'acord amb els criteris d'assignació del nitrogen de referència (quantitat de nitrogen de les dejeccions que es pot aplicar en terres situades en zona vulnerable) ni amb la instrucció tècnica que regula la verificació de l'estat de les basses establerts al Decret 153/2019, de 3 de juliol, de gestió de la fertilització del sòl i de les dejeccions ramaderes, ja que s'han fet unilateralment, sense tenir en compte l'opinió de les organitzacions agràries i sense haver-les informat del contingut. Per això, el sindicat demana que es paralitzi l'assignació del nitrogen de referència i la verificació de les basses mentre no hi hagi consens entre les organitzacions agràries i el Departament.
El sindicat defensa que el nitrogen de referència s'atorgui segons les condicions autoritzades de gestió de les dejeccions i que, d'acord amb aquestes, els ramaders segueixin complint amb l'obligació de gestionar, tal com s'hi havien compromès, la quantitat autoritzada que poden aplicar en zona vulnerable, la que cal aplicar fora de zona vulnerable o la que cal tractar. Aquestes condicions estan establertes en els criteris aplicats a les autoritzacions atorgades abans del 2009 i en el Decret 136/2009, d'1 de setembre. Tot això, per tal de garantir que les explotacions familiars que gestionaven les dejeccions com a fertilitzant en terres situades en zona vulnerable a l'entrar en vigor el decret ho puguin seguir fent.
Durant el cinc anys que ha durat la discussió del Decret, Unió de Pagesos ha treballat per aconseguir una normativa que garanteixi una aplicació correcta de les dejeccions i la fertilització, així com una gestió que redueixi al màxim la burocràcia i que no estableixi limitacions i obligacions que vagin més enllà de la normativa europea i que suposin costos addicionals per a les explotacions. Unió de Pagesos va interposar un recurs contenciós administratiu davant del Tribunal Superior de Justícia de Catalunya l'octubre del 2019 contra diversos articles del Decret no modificats d'acord amb les esmenes presentades pel sindicat.
Així mateix, a finals del 2019, Unió de Pagesos va proposar a Agricultura modificacions per corregir diversos aspectes del decret. Pel que fa a la verificació de les basses de purins, es va demanar que el buidatge no sigui total obligatòriament si permet comprovar la impermeabilitat, la integritat estructural i l'estat dels materials impermeabilitzants. El sindicat també ha proposat que es contempli la possibilitat d'instal·lar a les basses existents piezòmetres, aparells que permeten detectar fuites i que serveixin per verificar l'estanqueïtat, i també que s'excloguin de la verificació les basses existents de capacitat igual o inferior a 200 m3 .
Unió de Pagesos defensa, com a mesura urgent per a la ramaderia, un decret llei per deixar sense efecte les obligacions addicionals del Decret de fertilització, amb l'objectiu d'ajustar-lo estrictament a les obligacions europees i deixar, almenys fins el 2028, l'assoliment de la resta d'objectius ambientals i de gestió agronòmica a les mesures de foment de la Política Agrària Comuna (PAC).